La collaboration avec l’INRA a démarré dès la création du Gerdal sur la question « des raisons des pratiques des agriculteurs », autour de l’idée, propre aux chercheurs du SAD, « que les agriculteurs ont de bonnes raisons de faire ce qu’ils font ». Les travaux de terrain et les séminaires de formation animés par Jean-Pierre Darré ont permis d’expérimenter et de mettre au point des outils d’un dialogue compréhensif entre chercheurs et agriculteurs, marquant durablement les premiers dans leur manière de raisonner et de conduire leurs activités de recherche, comme le rappelait Bernard Hubert lors de la journée en hommage à Jean-Pierre Darré en septembre 2014 (Cf. SAD Info nov 2014). Ces collaborations ont donné lieu en 1993 au numéro de la revue Etudes Rurales : « Raisons et pratiques. Dialogue avec un éleveur ovin » (Darré et al, Etudes rurales n° 131-132), puis à l’ouvrage majeur « Le sens des pratiques. Conceptions d’agriculteurs et modèles d’agronomes », coordonné avec Jacques Lasseur et Anne Mathieu (Darré, Mathieu, Lasseur, 2004).

La collaboration avec l’INRA SAD a aussi porté, dès les années 1990, sur la recherche-action, au sein de chantiers tels que le programme AGREV (Agriculture et Environnement à Vittel, sur le lien entre agriculture et qualité de l’eau), ou le programme Aramis PNRZH (programme national de recherche sur les zones humides), autour d’un enjeu de protection des zones humides sur les marais Charentais… Au cœur de ces chantiers, la question des conditions de la mise à contribution des agriculteurs dans la formulation et la résolution des problèmes à traiter, et de la position et du rôle du chercheur dans des dispositifs susceptibles de favoriser l’articulation entre connaissance scientifique et connaissances des praticiens. Un séminaire animé par Bruno Lémery et Claire Ruault en 1995- 1996 et s’appuyant sur une diversité de chantiers des chercheurs participants, a permis d’explorer les « Conditions et moyens de la coopération chercheurs – praticiens », et les questions méthodologiques que cela pose.